ومن أبرز 3 عيوب بتحديث النسخة الأخيرة Facebook Messenger، وهي كالآتي:
1- لاحظ العديد من المستخدمين تأخر في استجابة الهاتف، خاصة في الجزء العلوي، يسار الشاشة، حيث لا تستجيب تلك المنطقة عند الضغط عليها.
2- عانى البعض أيضا تعطل البرنامج فور تثبيت النسخة الجديدة، ومما اضطرهم إلى حذفه.
3- أدى حذف التطبيق من على الهواتف الذكية، إلى فقدان جميع المحادثات السابقة.
ولوحظت تلك المشاكل عند قيام بعض المستخدمين بحذف التطبيق، وتحميل التطبيق بالإصدار القديم؛ مما أدى إلى زوال المشكلة.