منذ بدء الاحتجاجات، تقول المنظمات المعنية بحقوق الانسان، ان مئات الاشخاص تم توقيفهم ويواجه العديد منهم محاكمات، في حين تم الحكم على عشرات آخرين بعقوبات تصل الى السجن المؤبد وسحب الجنسية.
وبحسب "فرانس 24" نقلت المنظمة في تقرير من 84 صفحة عن موقوفين قابلتهم قالوا انهم تعرضوا للتعذيب والاعتداء في سجون جو، مؤكدة تعرض البعض منهم الى صدمات كهربائية والاجبار على الوقوف لفترات مطولة، والتعرض للبرد الشديد، والانتهاك الجنسي على أيدي قوات النظام.
ودعا نائب المدير التنفيذي لقسم الشرق الاوسط وشمال أفريقيا بالمنظمة جو ستورك، سلطات المنامة الى اتخاذ خطوات هامة لمعالجة غياب المحاسبة على الانتهاكات التي يتعرض لها المحتجزين، موصياً بتشكيل لجنة رقابية مدنية مؤلفة من خبراء مستقلين للتدقيق في عمل وحدة التحقيق الخاصة، ودعوة المقرر الخاص للأمم المتحدة المعني بالتعذيب لزيارة البلاد دون قيود.